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更新時間:2024-05-22
EpiCypher推出新品CUTANA™ CUT&Tag Kit,為組蛋白翻譯后修飾(PTM)的超靈敏定位提供了全面的解決方案。CUTANA™ CUT&Tag Kit使用專有的Direct-to-PCR策略,在一個管中即可完成從細胞到PCR文庫擴增,無需傳統(tǒng)的文庫制備流程,最大限度地減少樣本損失。與多道移液器兼容,提高了通量和重復(fù)性。
CUTANA™ CUT&Tag Kit添新品啦!助您輕松應(yīng)對CUT&Tag實驗
EpiCypher推出新品CUTANA™ CUT&Tag Kit,為組蛋白翻譯后修飾(PTM)的超靈敏定位提供了全面的解決方案。CUTANA™ CUT&Tag Kit使用專有的Direct-to-PCR策略,在一個管中即可完成從細胞到PCR文庫擴增,無需傳統(tǒng)的文庫制備流程,最大限度地減少樣本損失。與多道移液器兼容,提高了通量和重復(fù)性。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTM) 通過功能基團或蛋白質(zhì)的共價添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個蛋白質(zhì)的降解來增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙?;⒅|(zhì)化和蛋白水解,幾乎影響正常細胞生物學和發(fā)病機制的所有方面。染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)作為用于研究組蛋白的各種共價修飾與基因表達的常用技術(shù),仍然具有相當?shù)木窒扌浴=陙?,基因組學和表觀遺傳學領(lǐng)域引入了兩種新穎的染色質(zhì)分析方法,即核酸酶靶向切割和釋放技術(shù)(CUT&RUN)與靶向剪切及轉(zhuǎn)座酶技術(shù)(CUT&Tag),克服了ChIP法的諸多缺點,令研究人員能夠用更低的成本、更高的效率得到信噪比更高、重復(fù)性更好的實驗結(jié)果。
什么是CUT&Tag技術(shù)?
CUT&Tag全稱Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag),是基于CUT&RUN的新興姊妹技術(shù)。在EpiCypher的CUT&Tag實驗流程中,孵育結(jié)合好特異性抗體與靶標蛋白后,加入蛋白 A、蛋白G與Tn5的復(fù)合物(pAG-Tn5),使得轉(zhuǎn)座體進入細胞并與抗體結(jié)合,間接地固定在靶蛋白上;激活Tn5酶的切割活性,將靶蛋白結(jié)合的DNA區(qū)域切斷,從而達到提取DNA、進行PCR擴增、構(gòu)建文庫的目的。在Tn5上融合了protein A/G抗體結(jié)合功能域的轉(zhuǎn)座體pAG-Tn5是該技術(shù)的核心,使研究者不必碎裂染色質(zhì)并跳過了傳統(tǒng)的文庫準備步驟(end repair, adapter ligation)。
CUT&Tag技術(shù)有何特色?
精簡化的工作流程跳過了傳統(tǒng)ChIP-seq具有挑戰(zhàn)性的步驟,包括染色質(zhì)碎片和抗體下拉,用更少的細胞和測序讀段生成高分辨率數(shù)據(jù)。
◆ 更短的實驗周期
在兩天內(nèi)能夠完成從細胞到文庫的建立,而傳統(tǒng)的ChIP-seq需要五天(或更長時間)。
◆ 更少的細胞需求量與更低的成本
CUTANA™CUT&Tag分析僅使用10000-100000個細胞核即可生成高分辨率的圖譜,甚至可用于單細胞水平測序,便于單細胞或珍貴樣本的分析;與傳統(tǒng)ChIP-seq(需要約3000萬次讀取)相比,CUT&Tag檢測僅需要500-800萬次測序讀段,節(jié)省實驗成本。
◆ 更高的信噪比
CUTANA™CUT&Tag使用較少的起始細胞、更少的測序讀段,也能得到較低的背景信號和較強的目的信號。
◆ 無需文庫準備步驟
測序文庫的準備工作既費時又昂貴。通過在抗體結(jié)合的目標位點添加測序適配器,能夠?qū)崿F(xiàn)跳過傳統(tǒng)的文庫準備步驟(end repair, adapter ligation),極大地簡化了實驗流程。EpiCypher的CUTANA™CUT&Tag分析通過直接從反應(yīng)混合物中擴增標記DNA進一步簡化了這一策略,實現(xiàn)在一個管中完成從細胞到PCR文庫擴增。
產(chǎn)品信息
貨號 | 品名 | 規(guī)格 |
14-1102 | CUTANA™ CUT&Tag Kit , Primer Set 1 | 48 reactions |
14-1103 | CUTANA™ CUT&Tag Kit , Primer Set 2 | 48 reactions |
CUTANA™ CUT&Tag試劑盒:用戶友好的表觀基因組分析工具
試劑盒內(nèi)包括CUT&Tags實驗所需所有組分與對照品:
? 對照抗體 (Control antibodies)
? spike-in對照 (Nucleosome spike-in controls)
? 詳細的質(zhì)控分析評價指標 (Detailed quality control metrics)
? 故障排除小貼士 (Troubleshooting tips)
試劑盒組分(藍色的為EpiCypher特-有的組分)
名稱 | 貨號 |
pAG-Tn5 | 15-1017 |
H3K27me3 Positive Control Antibody | 13-0055t |
Rabbit IgG Negative Control Antibody | 13-0042t |
Anti-Rabbit Secondary Antibody | 13-0047 |
SNAP-CUTANA™ K-MetStat Panel | 19-1002t |
ConA Beads | 21-1401 |
Non-Hot Start 2X PCR Master Mix | 15-1018 |
8-strip Tubes | 10-0009t |
4.5 M NaCl | 21-1013 |
0.5 M EDTA | 21-1014 |
1 M MgCl2 | 21-1015 |
TAPS Buffer | 21-1016 |
SDS Release Buffer | 21-1017 |
SDS Quench Buffer | 21-1018 |
0.1X TE Buffer | 21-1019 |
Pre-Wash Buffer | 21-1020 |
Pre-Nuclear Extraction Buffer | 21-1021 |
Bead Activation Buffer | 21-1022 |
5% Digitonin | 21-2023 |
1 M Spermidine | 21-1024 |
SPRIselect reagent manufactured by Beckman Coulter, Inc | 21-1404 |
Multiplexing Primers | 14-1102 and 14-1103 each contain combinatorial dual indices for multiplexed sequencing of up to 48 reactions. Combine the kits to multiplex up to 96 reactions. |
CUTANA™ CUT&Tag試劑盒特點
? 可對低數(shù)量的細胞進行可靠的分析
? 從細胞到測序僅需2天
? 與ChIP相比檢測成本更低
? 獨-有的單管流程,最大限度提高回收率并簡化您的工作流程
EpiCypher是一家成立于2012年的表觀遺傳學公司。從專有組蛋白肽陣列平臺EpiGold™開始,EpiCypher開發(fā)了一系列同類產(chǎn)品。同時,EpiCypher是重組核小體制造和開發(fā)的全球領(lǐng)-導(dǎo)-者。利用其獨-有技術(shù),不斷添加高純度修飾重組核小體(dNucs™)產(chǎn)品。dNuc™多樣性的產(chǎn)品為破譯組蛋白編碼和加速藥物開發(fā)提供了強大的工具。EpiCypher還將dNuc™技術(shù)廣泛的應(yīng)用于多種分析測定產(chǎn)品中,包括:SNAP-ChIP®Spike-in Controls(用于抗體分析和ChIP定量), EpiDyne®底物(用于染色質(zhì)重塑和抑制劑篩選及開發(fā)),dCyher™測定(用于探究表觀遺傳蛋白質(zhì)-組蛋白PTM結(jié)合相互作用)。最近,EpiCypher還推出了針對ChIC、CUT&RUN和CUT&Tag的高靈敏度表觀基因組圖譜CUTANA™分析。
如需了解更多詳細信息或相關(guān)產(chǎn)品,請聯(lián)系EpiCypher中國授權(quán)代理商-欣博盛生物